[经验总结] Gromacs轨迹分析工具g_traj

tecpenguin

版主

Rank: 8 Rank: 8

帖子: 239
积分: 102
威望: 37
金币: 791
贡献: 11
讨论指数: 28
文献应助: 0

热心会员勤奋勋章我型我秀管理团队卓越贡献

楼主大中小发表于 2008-6-27 20:36 只看该作者

Gromacs轨迹分析工具g_traj

几乎gromacs的所有分析数据都可以输出为xmgrace的数据文件，g_traj可以产生gromacs轨迹的各个组的坐标，速度，受力和边界等等。使用” -com “参数可以求出轨迹中各个组的质心的坐标，速度，受力等；使用” -mol “则可以求取系统中各个分子的信息；” -ot “则可以求出系统中各个组的温度。还有几个其他参数，比如” -cv “可以求平均速度，” -cf “可以求平均受力等。其他参数同其他命令无异，参加说明文件。

搜索更多相关主题的帖子: traj 轨迹 Gromacs 工具参数