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[经验总结] Gromacs轨迹分析工具g_traj

tecpenguin

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楼主 大 中 小 发表于 2008-6-27 20:36  只看该作者

Gromacs轨迹分析工具g_traj

几乎gromacs的所有分析数据都可以输出为xmgrace的数据文件，g_traj可以产生gromacs轨迹的各个组的坐标，速度，受力和边界等等。使用” -com “参数可以求出轨迹中各个组的质心的坐标，速度，受力等；使用” -mol “则可以求取系统中各个分子的信息；” -ot “则可以求出系统中各个组的温度。还有几个其他参数，比如” -cv “可以求平均速度，” -cf “可以求平均受力等。其他参数同其他命令无异，参加说明文件。

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  • homeboy 金币 +10 2008-6-28 01:16

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qtzhou

小周


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沙发 大 中 小 发表于 2008-7-14 10:27  只看该作者
版主最好把你自己使用是的命令拿出来看看,还不是很明白 :lol: :lol:

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