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[版面公告] 本版计划整理一个gromacs入门的教程

本版计划整理一个gromacs入门的教程

要求:
    涵盖gromacs计算的各个细节
    计算量不大,易于模仿和实现
    包括一些术语的详细解释和说明
大家还有什么好的Idea,  请回帖!

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我是这么想的,可以分为:例子教程系列(中文和英文的),出错信息系列,每个命令分析讲解系列,还有心得笔记系列,问题讨论系列,相关文献资料和前沿发展.有些内容论坛上已经有帖子了,可以整合一下.
支持版主的工作,希望越做越好!
阳光直树

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很好的一个计划,支持。最好包括下载安装内容。

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回复 沙发 yyhsz04 的帖子

有想参加整理得朋友吗?可以来这里报道

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我愿意参与:)
baomin

[ 本帖最后由 gromacs 于 2008-6-29 15:58 编辑 ]
手擎六脉神剑,指点斗转星移

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回复 5楼 gromacs 的帖子

谢谢,等人多一些我们再具体的商量

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我坚决支持这个想法阿

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支持,算我一个
为避免资源重复,发贴前请先搜素论坛,注意选择标题或者全文搜索
请多发好贴,多参加讨论交流
学术交流,灌水者请自重
分子模拟论坛站务信箱

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支持!!
阳光总在风雨后!

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什么也不说了,眼泪哗哗的
[yctbq42]

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多谢大家的支持。这是iamjoan0928的建议另外我从初学者的角度看,建立输入文件和结果分析是难点,输入文件中力场参数文件的建立,以及如何检验选择的参数是否合理对于初学者是比较难的,结果分析我们可以先把gromacs中自带的分析工具讨论一下,主要是要写工具应用的心得,像sensenbobo的博客里就写得相当好,如果仅仅是翻译好像用处不大,自编程序分析的估计参与者就少了。
这是我整理的:
首先表示感谢,我整理一下你对建立gromacs入门手册的建议是:
1建立输入文件
2结果分析
3输入力场参数文件的建立
4如何检验选择的参数
我觉得这个入门手册可以先做一个试样板,放在网上由大家去完善,可以参考Gauss的入门手册的制作方法。
注重实际操作与理论想结合,更重要的是注重实际操作。可以建立经验分享部分,对同一个常见的问题进行几个角度的展开分析。大家还有什么好的建议吗?我先把以上的建议整理起来了。

[ 本帖最后由 tecpenguin 于 2008-6-30 15:11 编辑 ]

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顶 准备学习一下gromacs
The Road Ahead

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回复 12楼 childs 的帖子

楼上的也开个NAMD专区吧!
阳光总在风雨后!

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感受到了 大家庭的温暖。
向各位同学学习。

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强力支持哦!

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