UBUNTU下编译安装AMBER 9
这是我很久前前写的了,只因为之前的帖子不知道怎么回事坏掉了,所以只好删了重发。欢迎大家分享编译心得。
系统ubuntu 7.04-i686, ifort, icc, MKL已经装好了,版本是10.0.023, MKL 9.1
主要的安装说明都是参照INSTALL文件来的
首先安装补丁:
到http://amber.scripps.edu下载
patch -p0 -N -r patch-rejects < bugfix.all
sudo apt-get install xlibs-dev byacc
cd $AMBERHOME/src
export AMBERHOME=/home/homeboy/amber9
export MKL_HOME=/opt/intel/mkl/9.1
./configure ifort_ia32
make serial
安装并行版本
export MPI_HOME=/home/homeboy/lam-7.1.2-icc
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MPI_HOME/lib
make clean
./configure -lam ifort_ia32
make parallel
p.s. 编译过程中可能会提示缺库文件,缺什么装什么~
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