对于大多数初学量化的人，gaussian软件无疑是最佳的首选，而gaussview由于其易用性与实用性而成为建模的好工具。但是gaussview建模存储格式是有限制的，不能用于大多数计算，而MS涵盖了很多文件格式，可用于大多数软件计算，下面就来讲讲如何用gaussview建模，MS计算。

首先，用gaussview建一个模型，将其格式存储为MDL mol files （*mol），注意存储路径不能有中文，否则MS无法打开文件。
下面打开MS界面，选择file-inport，导入所生成的文件即可。
看到了3d结构，剩下的你想怎么算就怎么算，哈哈

注意：此方法不能做周期性结构的转化，如果你有了好方法可别忘了给大家分享啊！！！

[ 本帖最后由 tangsw911 于 2008-7-5 09:08 编辑 ]

想问楼主如何用这些软件建立groamcs的单个小有机分子的.gro文件呀？

若为原创请把主题图标改为“原创”

建议楼上的同学在学习gromacs之间先把单词拼写搞对呀。

谢谢啦

学习中

周期性还是很重要啊，继续学习中