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怎么将MS的结构转化为Gaussian的输入文件

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发表于 2009-3-17 21:41:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在materials studio中建立了结构模型,怎么把结构模型参数转换为gaussian的输入文件?
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发表于 2009-3-17 22:04:00 | 显示全部楼层
先在MS下存成.mol格式,然后用GaussView打开,在存为.gjf格式!
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 楼主| 发表于 2009-3-18 04:42:00 | 显示全部楼层
非常感谢
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 楼主| 发表于 2009-3-19 01:21:00 | 显示全部楼层
但是还是发现了个问题,在MS中周期性的晶体结构无法保存为.mol格式输出
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发表于 2009-3-19 22:33:00 | 显示全部楼层
晶体是不是可以保存成pdb格式啊,那也可以在GaussView中打开;我没有试过,你多试一试,再来告诉我们吧!
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 楼主| 发表于 2009-3-21 18:20:00 | 显示全部楼层
pdb用gaussview打开会显示为蛋白质结构
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发表于 2009-4-1 05:16:00 | 显示全部楼层
就是你用ms生成 .car 文件,借助于molden ,具体操作如下图:
1.molden1.car(假如是1.car)
2.鼠标指向正方体的图标。
最后就生成了VASP 用的POSCAR 文件了。
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