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有用Charmm力場來計算pKa值的軟件嗎?

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发表于 2009-10-28 16:47:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
請問有沒有免費的軟件是使用Charmm力場來計算蛋白質的pKa值的呢?
我用H++計算pKa,結果才發現他是用Amber力場,
所以得到的pdb檔中原子的順序和命名就跟Charmm的不一樣了。
可是我是用Charmm力場的namd使用者,如果要用手改,工程實在太浩大了,真傷腦筋。
有沒有什麼解決的方法呢?
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