[讨论交流] 如何将unit 用tleap 复制 unit, tleap

Elizabeth

向各位大虾请教，建好了一个unit, how to re duplicate the unit 1*3*3 in x,y dimention,any body how to do it?

Thanks

sobereva

例如把名为ttt的unit在z方向作一次复制，相隔5埃

a=copy ttt
translate a {0 0 5}
ttt=combine {a ttt}
依此类推

Elizabeth

thank you so much,sobereva.我能再向您请教个问题么。
我在用MM_GBSA算binding energy 的时候，最后有好几项 Energy。such as

ELE               -8.21       7.60
VDW              -20.20       2.07
INT               -4.72       1.09
GAS              -33.14       7.93
GBSUR             -3.08       0.16
GB                10.08       5.45
GBSOL              7.00       5.40
GBELE              1.86       4.77
GBTOT            -26.14       5.06

In the tutorial ,it's said the INT = internal energy arising from bond, angle and dihedral terms in the MM force field. (this term always amounts to zero in the single trajectory approach).
INT 应该是0的，可是我算的都不等于0，这是怎么回事呢？我计算的有问题出在那里呢？

谢谢你