返回列表 回复 发帖 点我体验网上斗地主的乐趣

[讨论交流] sybyl8.0的comfa疑问

相关搜索: comfa, 疑问
本人在做实验室合成的一类化合物的qsar

我先用sketch模块画结构,然后通过电荷最小化优化结构

建立分子表

接着align database,骨架叠合

输入PIC50,计算comfa,用过多种探针及步长

计算PLS得的r^2最大也就0.5多

应该算可以了

输出图像,感觉怪怪的

然后optimize qsar,修饰出一系列的化合物,但都很奇怪,有些有很长的烃基链


请问叠合那里柔性叠合是怎么样的

还有分子优化后是不是还缺了构象确定

望指教
你说的构象确定是什么意思?不太明白
叠合有几种方式,你用的是哪种?你说的柔性叠合是基于什么叠的?
阳光直树
原帖由 yyhsz04 于 2008-9-1 09:29 发表
你说的构象确定是什么意思?不太明白
叠合有几种方式,你用的是哪种?你说的柔性叠合是基于什么叠的?
我用的是骨架叠合
返回列表

本站属于学术,非经营性网站
本站所有资源均来自于互联网,所有个人文章和言论并不代表本站立场,如发现有侵权行为,请与我们联系,我们将在3个工作日内做出相应处理并给予答复