我自己编了一个简单的top文件，运行grompp时出现了错误提示：Invalid order for directive defaults file "co2.itp",line2。 我觉得可能是我的top文件的问题，大家帮忙看看先谢谢了！
下面是上传的top文件，

没有写过defaults这项。刚看了一下manual,
note: generate pairs, FudgeLJ, FudgeQQ and N are optional, FudgeLJ is only used when generate pairs is set to ’yes'. 不知道是不是你的generate pairs这项的问题？

引用:

原帖由 eyra 于 2008-9-4 15:24 发表
没有写过defaults这项。刚看了一下manual,
note: generate pairs, FudgeLJ, FudgeQQ and N are optional, FudgeLJ is only used when generate pairs is set to ’yes'. 不知道是不是你的generate pairs这项的问题？ ...

我也刚刚看了manual ，我在上面附件的itp中的defaults 这项里面的设定都是默认的，我理解manual，当 generate=yes时，FudgeLJ, FudgeQQ and N这些值就可以用,当 generate=no时，FudgeLJ, FudgeQQ and N这些值就不可以用,
我在纯的溶剂模拟时上面的itp都没有问题，可是我把这两个溶剂混合时，再写了一个top时，就出现了问题

[ defaults ]在top里不能出现两次，你在两个itp都写了，应当去掉其中一个。

哦，因为我是新手都是第一次写，所以没有经验。谢谢sobereva的帮忙

有一点，当gnerate=no时，FudgeLJ, 不进行计算，但是FudgeQQ 是计算的。可以好好的google一下，好像去年有过这个讨论， David van der Spoel的最终说法，manual没有写清楚

我想问怎么样用一个default？我把其实一个.itp的default去掉还是有错误提示。我应该怎么写这个mixture像我这种情况，大家帮我看看，有空的能不能给我写一点作为提示。

还没有解决